Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms