Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms