Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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