Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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