Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRS1Q15050 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRS1Q15050 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms