Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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