Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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