Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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