Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms