Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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