Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms