Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms