Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD4Q13485 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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