Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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