Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-8■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 HOXB8-202ENST00000498634 502 ntTSL 312.41□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 NSMCE1-203ENST00000562039 260 ntTSL 311.38□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FUNDC2-206ENST00000485289 726 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FNTA-203ENST00000525099 7327 ntTSL 28.81□□□□□ -11e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.341e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FNTA-207ENST00000528400 601 ntTSL 25.47□□□□□ -1.531e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RNF141-205ENST00000534281 5818 nt4.74□□□□□ -1.651e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-14■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-14■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TAF13-202ENST00000461096 1076 ntTSL 510.65□□□□□ -0.73e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 218.74■□□□□ 0.595e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-9■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.726e-7■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.939e-9■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 57.66□□□□□ -1.189e-9■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 RPL36AL-201ENST00000298289 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-13■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 GPS1-205ENST00000578168 583 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-7■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 GPS1-203ENST00000392357 4076 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.053e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 BLOC1S5-206ENST00000627748 1273 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.554e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 BLOC1S5-201ENST00000244777 2445 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.464e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.214e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 BLOC1S5-203ENST00000475998 1017 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 16.1
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PABPC4Q13310 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NDUFS7-207ENST00000538523 931 ntTSL 220.85■□□□□ 0.936e-9■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NDUFS7-209ENST00000538929 630 ntTSL 417.93■□□□□ 0.466e-9■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.382e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.862e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 C11orf98-203ENST00000532786 774 ntTSL 220.13■□□□□ 0.812e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.552e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ATP5O-204ENST00000429064 442 ntTSL 37.18□□□□□ -1.261e-75■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ATP5O-202ENST00000417181 462 ntTSL 36.29□□□□□ -1.41e-75■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ATP5O-203ENST00000418933 415 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-75■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-14■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.49e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TAF10-202ENST00000527248 425 ntTSL 323.16■■□□□ 1.39e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.175e-36■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.819e-50■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 25.66□□□□□ -1.54e-27■■■□□ 16
PABPC4Q13310 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.157e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.097e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GUCD1-201ENST00000398245 1593 ntTSL 527.88■■■□□ 2.057e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 526.6■■□□□ 1.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.722e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 COMMD7-204ENST00000610160 1987 ntTSL 225.42■■□□□ 1.667e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-212ENST00000583564 377 ntTSL 324.11■■□□□ 1.457e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTPA-226ENST00000455292 949 ntTSL 523.38■■□□□ 1.333e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.337e-6■■■□□ 16
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