Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTGDRQ13258 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDRQ13258 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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