Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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