Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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