Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms