Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBBP4Q09028 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms