Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms