Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms