Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNDQ07001 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNDQ07001 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms