Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms