Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EN1Q05925 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EN1Q05925 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EN1Q05925 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EN1Q05925 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EN1Q05925 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms