Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms