Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms