Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMF1P82094 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms