Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB4BP68371 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB4BP68371 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms