Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms