Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms