Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAP25P60880 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms