Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCCD1P59942 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCCD1P59942 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms