Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABP4P57796 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABP4P57796 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABP4P57796 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms