Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARD18P57730 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD18P57730 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms