Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms