Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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