Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DAP3P51398 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms