Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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