Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA4P48169 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms