Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME1P48163 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ME1P48163 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ME1P48163 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ME1P48163 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms