Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDF5P43026 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDF5P43026 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms