Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms