Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLT4P35916 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLT4P35916 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLT4P35916 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLT4P35916 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLT4P35916 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLT4P35916 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT4P35916 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms