Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFC1P35251 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFC1P35251 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFC1P35251 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFC1P35251 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFC1P35251 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms