Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP6P35125 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP6P35125 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP6P35125 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP6P35125 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms