Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER1P34995 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms