Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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CASQ1P31415 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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