Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms