Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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COL4A5P29400 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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